SN/T 5203-2020
鱼类物种鉴定基因条形码的检测技术规范
Identification of fish species—Technical specification based on DNA barcoding
2021-07-01实施
2020-12-30发布
前 言
本文件按照GB/T1.12020的规定起草。
本文件由中华人民共和国海关总署提出并归口。
本文件起草单位;深圳市检验检疫科学研究院、中华人民共和国深圳海关、深圳华大海洋研究院、深圳市农产品质量安全检验检测中心。
1 范围
本标文件定了鱼类基因条形码鉴定中的样品处理、基因扩增、序列分析、比对鉴定及结果判定等操作程序和规范。
本文件适用于对自然环境种化产生的野生型鱼类或其残存的组织进行物种鉴定 。不活合杂交选育的品种。
2 规范性引用文件
下列文件中的内容通过文中的规范性引用而构成本文件必不可少的条款。其中，注日期的引用文件、仅该日期对应的版本适用于本文件;不注日期的引用文件、其最新版本（包括所有的修改单）适用于本文件。
GB/T6682 分析实验室用水规格和试验方法
3 术语和定义
下列术语和定义适用于本文件。
3.1
基因条形码 DNA barcoding
可用于物种鉴定的具有生物物种序列特征的 DNA片段，本标准中指负类线激体基因组中 COI 基因658 bp的标准片段。
3.2
基因条形码鉴定技术 DNA barcoding identification technique
一种利用基因片段进行生物物种鉴定和系统讲化关系研究的技术，建立在基因扩增和序列比对的基础之上，它具有不受物种发育状态、雌雄性个体及形态特征完整性与否的限制、减少对分类专家的依赖、不受主观因素影响、准确率高、借助互联网可以实现数据共享等特点。
3.3
序列相似度 similarity of the sequences 反映序列间相似程度的数值，一般以百分数表示。
3.4
FASTA格式 FASTA format
生物信息学术语，又称Pearson 格式，是一种用文本表示核苷酸序列或者氨基酸序列的格式。核苷酸或者氨基酸碱基用单个字母表示，序列的第一行一般用">"起始，随后可以添加序列名或者注释。第一行为序列本身，只允许使用既定的核苷酸或者多基酸校编吗符号。如核苷酸使用ATCG表示，序列中不能出现回车等字符。