
SN/T 5179-2021
二代测序法检测蜚蠊携带细菌性样品制备方法
Protocol for sample preparation of cockroach-borne bacteria detection with next-generation sequencing
2022-01-01 实施
2021-06-18发布
本文件按照 GB/T 1.1—2020《标准化工作导则 第 1 部分:标准化文件的结构和起草规则》的规定起草。
本文件由中华人民共和国海关总署提出并归口。
1 范围
本文件规定了蜚蠊携带细菌性样品进行二代测序检测的样本采集、前处理、体内外携带细菌的
收集及基因组 DNA 的获取和扩增等操作程序。
本文件适用于利用二代测序技术对本底调查或口岸截获的蜚蠊携带未知细菌进行高通量检测鉴定的样品制备工作。
2 规范性引用文件
下列文件中的内容通过文中的规范性引用而构成本文件必不可少的条款。其中,注日期的引用文件,仅该日期对应的版本适用于本文件;不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。
GB/T 6682 分析实验室用水规格和试验方法
GB 19489 实验室 生物安全通用要求
SN/T 2752.4 卫生检疫人员的自我防护规范 第 4 部分:实验室人员
SN/T 4278—2015 国境口岸医学媒介昆虫 DNA 条形码鉴定操作规程
WS/T 230 临床诊断中聚合酶链反应(PCR)技术的应用
3 术语和定义
下列术语和定义适用于本文件。
3.1
引物标记 primer marker
在常规引物5'端加入的一段6~12个随机设计的碱基序列,用于标记并区分特定样品的扩增反应。
3.2
标签引物 labeled primer
由引物标记加常规引物两部分构成,每一个样品进行 PCR 扩增时需保证使用的一对引物中,至少有一条与其他样品使用的引物标记不同。